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- vers 40 après J.-C.-vers 90 : Dioscoride fait paraître vers 60 De materia medica, un ouvrage sur les produits médicinaux et qui décrit un peu moins d'un millier de plantes. Il restera en usage au moins jusqu'au XVIe siècle.
- Vincent de Beauvais (v. 1190-1264) fait paraître une importante compilation des connaissances de son temps. Plus critique et fin que Thomas de Cantimpré (1201-1263) à la même époque, il préfigure les encyclopédistes de la Renaissance. Il fut surnommé le Pline du moyen âge.
- 1601 : parution de Rariorum plantarum historia de Charles de l'Écluse (1525-1629) qui regroupe ses ouvrages précédents. Sa classification n'est pas très évoluée mais ses descriptions sont excellentes.
- 1605 : Claude Duret (v. 1570-1611) fait paraître Histoire admirable des plantes et herbes esmerveillables et miraculeuses en nature... (Paris, 1605) où il décrit des plantes étranges pour un arbre dont les feuilles s'enfuient sur de petites pattes lorsqu'elles touchent terre.
- 1635 : publication de l'Édit royal créant le Jardin du roi à Paris. Il est officiellement inauguré en 1640. Il a pour vocation, comme son nom l'indique, Jardin royal des plantes médicinales, de cultiver uniquement des plantes médicinales.
- 1640 : parution de Theatrum botanicum de John Parkinson.
- 1670 : publication de la première flore de Grande-Bretagne : Catalogus plantarum Angliæ et insularum adjacentium de John Ray.
- 1671 : Marcello Malpighi fait paraître une étude sur l'anatomie végétale marquant le début de cette discipline.
- 1686 : Début de la parution de Historia plantarum generalis de John Ray, première tentative d'une flore du globe. Il y présente une définition de l'espèce très proche de celle utilisée par Linné plus tard.
- 1694 : Rudolf Jakob Camerarius fait paraître De Sexu Plantarum Epistola où il démontre le rôle des étamines et du pistil dans la reproduction végétale.
- 1705 : mort de John Ray, fondateur de la botanique moderne.
- 1718 : le Jardin du roi devient un véritable établissement d'étude des végétaux et plus seulement des espèces à valeurs médicales.
- 1727 : Stephen Hales publie le résultat de ses recherches sur la respiration des plantes.
- 1762 : parution du premier ouvrage français employant le système du binôme linnéen, Hortus regius monspeliensis d'Antoine Gouan (1733-1821), suivi en 1765 de la première flore régionale, Flora Monspeliaca.
- 1763 : Michel Adanson fait paraître ses Familles des Plantes qui propose une nouvelle méthode de la classification des plantes.
- 1779 : Jan Ingenhousz découvre le rôle de la lumière dans la photosynthèse.
- 1787 : Thomas Walter fait paraître la première flore de l'Amérique du Nord utilisant le système linnéen.
- À partir des années 1790, Erik Acharius, botaniste suédois, fait paraître des travaux sur la taxinomie des lichens et est considéré comme le fondateur de la lichénologie.
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