基因組
维基百科，自由的百科全书
在生物学中，一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遗传信息。基因组包括基因和非编码序列。1920年，德国汉堡大学植物学教授汉斯.温克勒（Hans Winkler）首次使用基因组这一名词。
更精确地讲，一个生物体的基因组是指一套染色体中的完整的DNA序列。例如，生物个体体细胞中的二倍体由两套染色体组成，其中一套DNA序列就是一个基因组。基因组一词可以特指整套核DNA（例如，核基因组），也可以用于包含自己DNA序列的细胞器基因组，如线粒体基因组或叶绿体基因组。当人们说一个有性生殖物种的基因组正在测序时，通常是指测定一套常染色体和两种性染色体的序列，这样来代表可能的两种性别。即使在只有一种性别的物种中，“一套基因组序列”可能也综合了来自不同个体的染色体。通常使用中，“遗传组成”一词有时在交流中即指某特定个体或物种的基因组。对相关物种全部基因组性质的研究通常被称为基因组学,该学科与遗传学不同，后者一般研究单个或一组基因的性质。
目录 |
[编辑] 基因组的种类
大部分生物体比病毒复杂，除了染色体，有时或总是包含额外的遗传物质。某些情况下，比如对致病微生物的基因组测序，这里基因组就包含了在质粒中的遗传物质。在这种情况下基因组就包含了所有的基因和非编码DNA。
而对于像人类这样的脊椎动物，基因组通常指的只是染色体DNA。因此，尽管人类线粒体里包含了基因，但这些基因并不作为基因组的一部分。事实上，有时候称线粒体拥有自己的基因组，通常叫做线粒体基因组。
[编辑] 基因组和遗传变异
必须指出仅有一个基因组并不能获得物种的遗传差异或遗传多态性。例如，原则上讲，人类基因组序列可以仅仅从某个个体的一个细胞的一半DNA中测定。要知道是哪些DNA变异导致特定性状或疾病则需要进行个体间比较。这一点也解释了通常使用“基因组”（与通常使用“基因”相提并论)不仅仅指某特定DNA序列，也指某物种整个家族的序列。
尽管这个概念看上去与直觉相抵触，其实这与说没有任何一个特定的形状是印度豹的形状是相同的概念。印度豹形状各异，它们的基因组序列也并不相同。然而各动物个体和它们的序列都有共性，因此可以从单一实例中来了解印度豹和“豹性”。
[编辑] 最小基因组
既然基因组和相应生物体如此复杂，一种研究策略就是减少基因组中的基因数目至最小但仍可以使生物体理论上可以生存。对于单细胞生物和多细胞生物最小基因组的实验研究已经开展（见发育生物学）。这些工作在体内和体外进行。通过理解最小生物体的功能，然后不断增加其复杂性，从而理解诸如癌症等多细胞疾病。（见#参考资料）
[编辑] 基因组计划
主条目: 基因组计划
人类基因组计划旨在对人类基因组绘制物理图谱并测序。其他基因组计划包括小鼠，水稻，拟南芥，河豚和细菌（如大肠杆菌）等。通过各种基因组计划，许多基因组已被测序。测序费用一直在降低，可能最终测序单个基因组只需要几千美元。
比较: 蛋白质组
[编辑] 不同基因組大小的比較
要得到已测序基因组以及大小的最新列表，请访问DOGS
| 生物 | 基因組大小（鹼基對） |
|---|---|
| 病毒, 噬菌體Φ-X174; | 5387 - 最早完成測序的基因組 |
| 病毒, 噬菌體λ | 5×104 |
| 细菌, 大腸桿菌 | 4×106 |
| 變形蟲, 無恒變形蟲(Amoeba dubia) | 67×1010 - 2005年12月已知的最大基因組 |
| 植物, 一種貝母(Fritillary assyriaca) | 13×1010 |
| 真菌,釀酒酵母 | 2×107 |
| 線蟲, 秀麗隱桿線蟲 | 8×107 |
| 昆蟲, 黑腹果蠅 | 2×108 |
| 哺乳動物, 人 | 3×109 |
註：一個人類細胞的DNA長度約爲1.8米。
[编辑] 基因組演化
Genomes are more than the sum of an organism's genes and have traits that may be measured and studied without reference to the details of any particular genes and their products. Researchers compare traits such as chromosome number, genome size, gene order, codon usage bias, and GC-content to determine what mechanisms could have produced the great variety of genomes that exist today (for recent overviews, see Brown 2002; Saccone and Pesole 2003; Benfey and Protopapas 2004; Gibson and Muse 2004; Reese 2004; Gregory 2005).
Duplications play a major role in shaping the genome. Duplications may range from extension of short tandem repeats, to duplication of a cluster of genes, and all the way to duplications of entire chromosomes or even entire genomes. Such duplications are probably fundamental to the creation of genetic novelty.
Horizontal gene transfer is invoked to explain how there is often extreme similarity between small portions of the genomes of two organisms that are otherwise very distantly related. Horizontal gene transfer seems to be common among many microbes. Also, eukaryotic cells seem to have experienced a transfer of some genetic material from their chloroplast and mitochondrial genomes to their nuclear chromosomes.
[编辑] 其他“-組”和“-組學”
- 基因組, 蛋白質組, 表達組, 代謝組, 調控組, 功能組, Phenome, Textome
- 線粒體組學, 高爾基體組學, Ligandomics, Eukaryome, Bacteriome, Archaeome
[编辑] 基因組的次領域
- Human genome, Mitochondriome, Eukaryome
[编辑] 參考資料
Benfey, P and Protopapas, AD (2004). Essentials of Genomics. Prentice Hall.
Brown, TA (2002). Genomes 2. Bios Scientific Publishers.
Gibson, G and Muse, SV (2004). A Primer of Genome Science (Second Edition). Sinauer Assoc.
Gregory, TR (ed) (2005). The Evolution of the Genome. Elsevier.
Reece, RJ (2004). Analysis of Genes and Genomes. John Wiley & Sons.
Saccone, C and Pesole, G (2003). Handbook of Comparative Genomics. John Wiley & Sons.
[编辑] 參見
[编辑] 外部鏈接
- Animal genome size database
- Plant genome size database
- Genomes OnLine Database
- The Genome News Network
页面分类: 翻譯請求 | 生物學中未解決的問題 | 遗传学
