Protéine membranaire
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Sommaire |
[modifier] Introduction
Les protéines membranaires sont des protéines retrouvés au sein de la membrane cellulaire. La quantité de gènes codant une protéine membranaire est estimée à environ 25% du génome[1]. Ce nombre très important reflète l'importance de cette classe de protéine, ainsi que la diversité des fonctions assurées, la plus fondamentale étant le lien entre le milieu extracellulaire et le milieu intracellulaire.
[modifier] Classification des protéines membranaires
[modifier] Topologies membranaires
Les protéines membranaires peuvent être classées en fonction des structures leur permettant d'interagir avec la membranane et la manière dont celles-ci s'agencent. Les types de structures mises en jeux et leurs organisations sont regroupés sous le terme de topologie membranaire.
[modifier] Protéines polytopiques
Les protéines polytopiques sont des protéines en contact avec les deux compartiments définis par la membrane. Les structures en contact avec la membranes peuvent être:
- A. une ou plusieurs hélices α transmembranaires (de 1 à plus de 20 par protéine[2]). Il s'agit de loin de la conformation transmembranaire la plus obervée.
- B. un tonneau β transmembranaire composé de 8 à 22 brins β[3].
[modifier] Protéines monotopiques
Les protéines monotopiques sont des protéines en contact avec un seul des compartiments définis par la membrane. Les structures en contact avec la membranes peuvent être:
- C. une ou plusieurs hélices α parallèle au plan de la membrane (de 1 à 3 par protéine). Ces hélices ont la particularité d'être amphipathique;
- D. des boucles hydrophopes;
- E. des liaisons covalentes à un lipide, ou lipidation : il s'agit souvent de N-acylation N-terminale (liaison à un acide gras) ou de glipiation C-terminale (liaison à un glycosylphosphatidylinositol);
- F. des liaisons électrostatiques à des lipides. Ces liaisons peuvent se faire directement avec des phospholipides ou par l'intermédiaire d'un ion;
[modifier] Classification biochimiques des protéines membranaires
Les protéines membranaires peuvent être classées en fonction de critères biochimiques, en particulier de leur difficulté à être extraite des membranes.
[modifier] Protéines intégrales
Il s'agit de protéines mono- ou polytopiques intéragissant fortement avec la membrane. Un détergent fort ou un solvent hydrophobe cassant la structure membranaire sont nécessaires pour les extraire.
[modifier] Protéines périphériques
Ils s'agit de protéines montopiques intéragissant faiblement avec la membrane, soit par liaisons électrostatiques , soit par l'interménaire d'autres protéines membranaires. Il n'est pas nécessaire de destructurer la membrane pour les extraire. Une force ionique élevée ou l'emploi d'un agent chaotropique peut suffire.
[modifier] Rôles des protéines membranaires
Le rôle d'une protéine membranaire peut être aussi varié que celui d'une protéine en général. Toutefois, trois types de fonctions reste très spécifiques des protéines membranaires :
- la translocation de composée à travers la membrane
- la réception/transmission de signaux à travers la membrane
- le modelage et la fusion des membranes
[modifier] Références
[modifier] Voir aussi
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