發酵也寫作醱酵，是指運用生物體，包括微生物、植物細胞、酵母菌，使有机物分解的生物化學反應过程。常見的醱酵技術用於製酒、豆類醱酵食品。
食品工业中经常应用发酵过程，应用到淀粉，可以使淀粉分解为较小的片段，同时放出二氧化碳，是制造面包的必须过程；应用到酿酒过程，使糖类分解成酒精同时放出二氧化碳；应用到制茶工艺，使茶叶中的没食子茶素分解再合成为茶黄素，使茶叶成为红茶；此外像制作腐乳、奶酪、酸奶等都需要发酵过程。
在製藥工業上，藉由大型生物反應器-醱酵槽，來進行抗生素等生產。現在，利用植物細胞之植物醱酵，真菌細胞等醱酵生物技術，生產高價之生物性醫藥產品。例如靈芝醱酵。
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