Геномика
Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Геномика — раздел молекулярной генетики, посвященный изучению генома и генов живых организмов.
Геномика сформировалась как особое направление в 1980—1990-х гг. вместе с возникновением первых проектов по секвенированию геномов некоторых видов живых организмов. Первым был полностью секвенирован геном бактериофага Φ-X174; (5 368 kb) в 1980 г. Следующим этапным событием было секвенирование генома бактерии Haemophilus influenzae (1.8 Mb) (1995). После этого были полностью секвенированы геномы еще нескольких видов, включая геном человека (2001 — первый черновой вариант, 2003 — завершение проекта). Её развитие стало возможно не только благодаря совершенствованию биохимических методик, но и благодаря появлению более мощной вычислительной техники, которая позволила работать с огромными массивами данных. Протяженность геномов у живых организмов подчас измеряется миллиардами пар оснований. Например, объем генома человека составляет порядка 3 млрд. пар оснований, или 3 000 Mb, а самые крупный из известных геномов (у одного из видов амёб) — 6.7×1011 пар оснований.
Получение полных последовательностей геномов позволило пролить свет на степень различий между геномами разных живых организмов. Ниже в таблице представлены предварительные данные о сходстве геномов разных организмов с геномом человека. Сходство дано в процентах (отражает долю пар оснований, идентичных у двух сравниваемых видов).
Эти данные были найдены в различных вторичных источниках, и, скорее всего, они были получены разными методами (такими, как гибридизация ДНК или sequence alignment). Следует отметить, что разные методы могут давать различные результаты, даже будучи примененными к одной и той же паре сравниваемых видов, поэтому все цифры, приведенные в данной таблице следует рассматривать, как весьма приблизительные.
Вид | Сходство | Источник |
---|---|---|
Человек | 99.9% | Human Genome Project |
100% | однояйцевые близнецы | |
Шимпанзе | 98.4% | Источник: Americans for Medical Progress; Jon Entine в San Francisco Examiner |
98.7% | Richard Mural из Celera Genomics, цитируется в MSNBC | |
Бонобо, или карликовый шимпанзе | То же, что и для шимпанзе. | |
Горилла | 98.38% | Основано на изучении интергенной неповторяющейся ДНК в Am J Hum Genet. (2001) Feb;682:444-56 |
Мышь | 98% | Источник: Americans for Medical Progress |
85% | при сравнении всех последовательностей, кодирующих белки, NHGRI | |
Собака | 95% | Jon Entine в San Francisco Examiner |
C. elegans | 74% | Jon Entine в San Francisco Examiner |
Банан | 50% | Источник: Americans for Medical Progress |
Нарцисс | 35% | Steven Rose в The Guardian 22 January 2004 |
Разделы генетики |
---|
Классическая генетика | Популяционная генетика | Генетика количественных признаков | Молекулярная генетика | Медицинская генетика |
Родственные статьи: Геномика | Генная инженерия | Генетик | Фармакогенетика |
|
---|
Анатомия | Биоинформатика | Биологическая систематика | Биология океана | Биология развития | Биология человека | Биофизика | Биохимия | Ботаника | Вирусология | Возникновение жизни | Генетика | Геномика | Гидробиология | Зоология | Космическая биология | Микология| Микробиология | Молекулярная биология | Палеонтология | Паразитология | Патология | Физиология | Цитология | Эволюционная биология | Экология |