クリストフ・シャイナー（Christoph Scheiner、 1575年7月25日（1573年説もある）- 1650年6月18日) はドイツの天文学者、イエズス会員。太陽の黒点を観測した最初の学者の一人である。
1611年に太陽の黒点をヨハン・シサットの助けを受けて観測した。シャイナーは黒点を太陽の衛星であると解釈した。1630年にRosa Ursinaを出版した。 黒点はガリレオによって1609年に見つけられたとされ、発見の太陽の表面の現象であるとするガリレオ・ガリレイと、どちらが先に発見したかも争われた。
シャイナーの黒点の記録は後に太陽の活動の長期的変動を調べるのに利用された。
シャイナーは死ぬまで、地動説に反対した。
ガリレオに、黒点発見の先取権の論争などによって敵意をいだいており、地動説を支持するガリレオとローマ教会が紛争にいたった一因であるとされる。
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