水質汚染（すいしつおせん）とは、経済活動などにより水の質が劣化する状態をいう。具体的な例として、水道法で定める飲料水の基準を悪化させる（細菌の増加、化学物質や有機物増加、色度や濁度の変化など）状態をいう。
河川・湖沼などの公共用水域は水質汚濁、海水や海域は海洋汚染として別に書き分ける。
公共用水域の水質汚濁や汚染物質・病原性微生物の混入により、上水道・工業用水道の水質の悪化が起こる。また、工業用水道・農業用水と上水道の誤接続などによって上水道に飲用に適さない水が供給されることがある。
このような場合、人の健康を害したり、機械・設備の動作不良を起こすことがある。これらを防止するため各種手法が用いられる。
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