Relation entre génomique, transcriptomique et protéomique
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Il existe des points communs entre la génomique, la transcriptomique et la protéomique. Mais elles se distinguent sur de nombreux points.
[modifier] Points communs
- Etudier l'ensemble des gènes, transcrits et protéines d'un organisme.
- Les techniques transcriptomiques très proche des techniques génomiques. En fait, en général, première étape de transcriptomique consiste à réaliser une transcription inverse pour transcrire l'ARN en ADN. Les techniques d'identification, d'amplification, de clonage et d'expression sont ensuite identiques.
- Les protéines et les transcrits d'ARN possèdent la même variabilité en fonction de l'environnement cellulaire. Régulation au niveau de la synthèse des ARN et des protéines.
[modifier] Différences
- Malgré les ressemblance qui existent entre les techniques de génomiques et transcriptomiques, le sujet d'étude est différent.
- Le génome est principalement fixe (dans le temps, dans les différents tissus) et spécifique d'un individu/organisme. Le transcriptome varie en fonction du temps, du tissu ou type cellulaire, de l'environnement et est spécifique d'un type cellulaire.
- Le génome est constitué de chromosomes d'ADN peu nombreux et de grande taille. Le transcriptome est formé de fragment d'ARN de petite taille, en grand nombre, très hétérogène.
- Plus grande variabilité des protéines que des transcrits
- plus de modifications post-traductionnelles (clivage protéolytique, modification d'acide aminé, ajoute de groupes phosphates/glucidiques/lipidiques…) que modification post-transcriptionnelles (épissage, modification de nucléotide)
- Les protéines ont plus de fonctions que les transcrits (peu de transcrit ARN ont une activité - sauf ARNsi, auto-épissage…)