Relation entre génomique, transcriptomique et protéomique

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Il existe des points communs entre la génomique, la transcriptomique et la protéomique. Mais elles se distinguent sur de nombreux points.

[modifier] Points communs

• Etudier l'ensemble des gènes, transcrits et protéines d'un organisme.
• Les techniques transcriptomiques très proche des techniques génomiques. En fait, en général, première étape de transcriptomique consiste à réaliser une transcription inverse pour transcrire l'ARN en ADN. Les techniques d'identification, d'amplification, de clonage et d'expression sont ensuite identiques.
• Les protéines et les transcrits d'ARN possèdent la même variabilité en fonction de l'environnement cellulaire. Régulation au niveau de la synthèse des ARN et des protéines.

[modifier] Différences

• Malgré les ressemblance qui existent entre les techniques de génomiques et transcriptomiques, le sujet d'étude est différent.

1. Le génome est principalement fixe (dans le temps, dans les différents tissus) et spécifique d'un individu/organisme. Le transcriptome varie en fonction du temps, du tissu ou type cellulaire, de l'environnement et est spécifique d'un type cellulaire.
2. Le génome est constitué de chromosomes d'ADN peu nombreux et de grande taille. Le transcriptome est formé de fragment d'ARN de petite taille, en grand nombre, très hétérogène.

• Plus grande variabilité des protéines que des transcrits

1. plus de modifications post-traductionnelles (clivage protéolytique, modification d'acide aminé, ajoute de groupes phosphates/glucidiques/lipidiques…) que modification post-transcriptionnelles (épissage, modification de nucléotide)
2. Les protéines ont plus de fonctions que les transcrits (peu de transcrit ARN ont une activité - sauf ARNsi, auto-épissage…)