印度尼西亚总统即为印度尼西亚国家元首、政府首脑和武装部队最高统帅。自2004年第六任总统的选举产生开始，总统和副总统改由全国直接选举，只能连选连任一次，每任五年；之前印尼总统由印尼人民协商会议选举产生。总统任命内阁，但需征得印尼国会同意。
| 顺序 | 中文名字 | 英语名字 | 就位时间 | 离位时间 |
| 第一任 | 苏加诺 | Sukarno | 1945年8月17日 | 1967年3月12日 |
| 第二任 | 苏哈托 | Suharto | 1967年3月12日 | 1998年5月21日 |
| 第三任 | 哈比比 | Baharuddin Jusuf Habibie | 1998年5月21日 | 1999年10月20日 |
| 第四任 | 瓦希德 | Abdurrahman Wahid | 1999年10月20日 | 2001年7月23日 |
| 第五任 | 梅加瓦蒂 | Megawati Sukarnoputri | 2001年7月23日 | 2004年10月 |
| 第六任 | 苏西洛 | Susilo Bambang Yudhoyono | 2004年10月 |
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