알레르겐(allergen)은 알레르기를 유발하는 물질이다. 알레르기는 주로 항체 중 IgE 유형에 의해 발생하는데, 사람마다 갖고 있는 IgE의 형태가 다르기 때문에, 각 사람에 대한 알레르겐도 다르게 된다. 또한, IgE는 끊임없이 만들어 졌다 사라지고 있기 때문에, 한 사람에 대해서도 특정 시기에 따라 알레르겐이 다를 수 있다. 그러나, 한 번 만들어진 IgE는, 그 IgE를 만드는 B세포가 계속 살아 있기 때문에, 없어지지 않는다. 이것이 특정 물질에 대해 알레르기 반응이 생기면 시간이 지나도 그 물질에 대해 계속 알레르기 반응을 일으키는 원인이다.
알레르겐은 매우 다양하다. 꽃가루, 생선, 금속, 공기 중의 먼지 등이 모두 알레르겐이 될 수 있다.
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