Complesso I
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Il complesso I, noto anche come NADH-CoQ reduttasi, catalizza il trasferimento di elettroni e di protoni dal NADH all'ubichinone. Purtroppo non si conosce la struttura del complesso lipoproteico.
Tale complesso contiene flavin mononucleotide, un cofattore molto simile al FAD che accetta due elettroni ed un protone provenienti dal NADH e un altro protone proveniente dalla matrice.
Inoltre nel complesso I troviamo anche ferro-zolfo proteine che sono in grado di accettare i protoni dall'FNMH2 e cambiando lo stato di ossidazione del ferro, attuano il trasferimento degli elettroni dall'FMNH2 all'ubichinone, che in questo modo si riduce ad ubichinolo. I due protoni sono pompati nello spazio tra le due membrane.
NADH+ CoQ (ubichinolo)+2H+------>NAD+H+ +CoQH2
Il processo di traferimento è irreversibile in quanto nel passaggio degli elettroni dipende dai potenziali standard di riduzione, infatti ogni elettrone va incontro ad una caduta di potenziale di circa 360mV che equivale ad un deltaG=-16,6 Kcal/mol. Questa energia guida la trasloscazione di 4 protoni nello spazio transmembrana.