البناء الكيميائيهو ترتيب الذرات فى الجزيء, وعادة ما تكون هذه الذرات مرتبطة بروابط كيميائية مثل الرابطة التساهمية. ويمكن للبناء الكيميائي أن يتراوح من البناء البسيط, مثل الجزيئات ثنائية الذرة مثل جزيء الأكسجين, إلى البناء البالغ التعقيد, مثل جزيء البروتين. ويمكن تمثيل البناء الكيميائي بواسطة المعادلة البنائية.
من الطرق الشائعة لتحديد البناء الكيميائي حيود الأشعة السينية.
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