Topoisomerase II
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| Topoisomerasen TypII | |
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| Synonyme | |
| EC-Nummer | 5.99.1.3 |
| CAS-Nummer | 142805-56-9 |
| Kategorie | Isomerasen |
| Reaktionsart | Einführung von Doppelstrangbrüchen, Hindurchführen eines Strangs durch entstandene Lücke, wiedervereinigung der Stränge |
| Substrate | DNA |
| Produkte | |
Topoisomerase II ist ein Enzym welches in allen Organismen vorkommt und Helix-Windungen von doppelsträngigen DNA-Strängen auflockern und lösen kann. Eine Besonderheit stellt die bakterielle Topoisomerase, auch Gyrase genannt, dar. Sie ist in der Lage auch zusätzliche Windungen in einen DNA-Strang einzuführen. Für ihre katalytische Funktion benötigt die Topoisomerase II im Gegensatz zur Topoisomerase I Energie in Form von ATP.
Es können zwei Subfamilien unterschieden werden.
| Subfamilie | Repräsentative Mitglieder |
| IIA |
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| IIB | Sulfolobus shibatae (Archea), Topoisomerase VI |
Das Molekulargewicht des Enzyms beträgt je nach Art des Organismus 160-180 KDa. Es handelt sich um ein dimeres Enzym, das aus zwei Monomeren besteht. Ein Monomer kann in drei Domänen untergliedert werden: N-Terminale Domäne, Zentrale Domäne und C-Terminale Domäne.
Die N-Terminale Domäne besteht aus ca. 660 Aminosäuren und dient der Bindung von ATP. Die zentrale Domäne besteht aus ca. 1200 Aminosäuren und enthält einen Tyrosinrest, der für das "zerschneiden" der DNA zuständig ist. Man spricht hier auch von der katalytischen Domäne. Die C-Terminale Domäne ist unterschiedlich lang und besteht aus vielen geladenen Aminosäuren. Sie enthält ein NLS-Motiv (Nukleäres Lokalisationssignal). Diese Domäne ist teilweise auch phosphoryliert. Die genaue Funktion dieser Domäne konnte noch nicht geklärt werden.
In der Praxis sind vor allem Gyrasehemmer von Interesse. Diese werden als Antibiotika eingesetzt. Zu den bekanntesten unter ihnen zählen zum Beispiel: Ciprofloxacin, Novobiocin.
