FASTA-Algorithmus
aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
Der heuristische FASTA-Algorithmus wurde 1985 von David J. Lipman und William R. Pearson als FASTP für Proteine entwickelt. Das Programm wurde 1988 auf Nukleotide erweitert.
FASTA sucht nach Ähnlichkeiten zwischen Sequenzen oder vergleicht eine gegebene Sequenz mit einer Datenbank. Ein Online Interface des Programms ist unter http://www.ebi.ac.uk/fasta33/ zu finden.
Die Speicherung der Sequenzdaten erfolgt im FASTA-Format.
[Bearbeiten] Literatur
- Lipman, D.J. and Pearson, W.R. (1985). Rapid and sensitive protein similarity searches. Science 227(4693), 1435-1441. PMID 2983426
- Pearson, W.R. and Lipman, D.J. (1988). Improved tools for biological sequence comparison. Proc. Natl. Acad. Sci. 85(8), 2444-2448. PMID 3162770
