RNA干扰
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RNA干扰(RNA_interference,简称RNAi)是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象。与其它基因沉默现象不同的是,RNAi具有传递性,可在细胞之间传播,在秀丽隐杆线虫上实验时还可使子一代产生基因突变。
RNAi与转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing and transgene silencing)在分子水平上被证实是同一种现象。
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[编辑] 定义
RNAi指的是当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时,该mRNA发生降解而导致基因表达沉默的现象。
[编辑] 步骤
RNA干扰过程主要有2个步骤:(1)长双链RNA被细胞源性的双链RNA特异的核酸酶切成21-23个碱基对的短双链RNA,称为小干扰性RNA(small interfering RNA)。(2)小干扰性RNA与细胞源性的某些酶和蛋白质形成复合体,称为RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC),该复合体可识别与小干扰性RNA有同源序列的mRNA,并在特异的位点将该mRNA切断。
[编辑] 背景
1998年,安德鲁·法厄(Andrew Z. Fire)等在秀丽隐杆线虫(C.elegans)中进行反义RNA抑制实验时发现,作为对照加入的双链RNA相比正链或反链RNA显示出了更强的抑制效果(Fire et al., 1998)。从与靶mRNA的摩尔比考虑,加入的双链RNA的抑制效果要强于理论上1:1配对时的抑制效果,因此推测在双链RNA引导的抑制过程中存在某种扩增效应并且有某种酶活性参与其中。随后,又相继发现具有RNase III活性的Dicer可将长的双链RNA加工成称之为siRNA(small interfering RNA)的21~23nt及3'端突出的短的双链RNA,siRNA与若干个蛋白组成称之为RISC复合物(RNA-induced silencing complex)的RNA蛋白复合物,并由该复合物主导RNAi效应。 2001年,Tuschl等将短的siRNA导入到哺乳动物细胞中并由此解决了在哺乳细胞内导入长的双链RNA时引发的干扰素效应,由此拓展了RNAi在基因治疗上应用前景。RNAi机制普遍存在于生物种中,因此被认为是进化上相对保守的基因表达调控机制。一种假说为,RNAi机制是作为在RNA水平上抵御病毒入侵的防御机制而存在的。目前发现,RNAi机制中的相关一些因子如内源性双链RNA及蛋白因子可以在多种层次上对基因表达进行调控,其范围已经超越了PTGS(post transcriptional gene silencing),如RNAi机制同样参与了转录水平上的基因表达调控过程中。 2006年,安德鲁·法厄与克雷格·梅洛(Craig C. Mello)由于在RNAi机制研究中的贡献获得诺贝尔生理及医学奖。
[编辑] RNAi的分子机制
由外界导入的长的双链RNA首先被称作Dicer并具有RNaseIII活性的RNA酶切割成21~23碱基对的小的双链RNA,这种RNA被称作small interfering RNA(siRNA),其特征是3'端相对于互补链突出两个碱基。完成上述过程后,siRNA上结合RNAi蛋白因子,并形成称为RISC(RNA-induced silencing complex)的RNA-蛋白复合物。在RISC复合物中,siRNA依赖于ATP/或ATP非依赖性的转换为单链,进而RISC被活化。活化型RISC受已成单链的siRNA引导(guide strand),序列特异性地结合在标靶mRNA上并切断标靶mRNA,引发靶mRNA的特异性分解。迄今为止已鉴定出包括Dicer在内的若干个与RNAi有关的蛋白因子。在果蝇(Drosophila melanogaster)RISC中,已知存在着称为Argonaute2(AGO2)的因子,AGO2蛋白的表达受到抑制时,RNAi效应缺失,也就是说AGO2是果蝇RNAi机制的必须因子。研究表明Argonaute家族蛋白具有RNA切割酶活性(slicer activity),RNAi机制正是由Argonaute家族蛋白的RNA切割酶活性主导。另外,几个RNA解旋酶(RNA helicase)也被鉴定为参与RNAi机制的因子。在秀丽隐杆线虫(C. elegans)的RNAi中必须的因子有EGO1,这是一种RdRP(RNA-dependent RNA Polymerase),植物中也存在该蛋白同系物。RNAi中RdRP是将标靶mRNA作为模板,以导入的dsRNA(或siRNA)作为引物合成RNA,在细胞内针对于标靶mRNA合成新siRNA的酶。这一反应在一些生物的RNAi中为必须,但RdRP活性在人和果蝇的RNAi中是非必须的,这说明在不同物种之间RNAi机制的基本框架虽然相同,但存在着微妙差异。