RNA polimerasi

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L'RNA polimerasi (RNAP o RNApol) è un enzima che catalizza la sintesi di un filamento di RNA. Generalmente con il nome RNA polimerasi si identifica la RNA polimerasi-DNA dipendente che, nel processo denomnato trascrizione sintetizza un filamento di RNA complementare ad uno stampo di DNA. Esistono anche RNA polimerasi-RNA dipendenti, coinvolte nel processo di replicazione del genoma di alcuni virus che possiedono un genoma ad RNA.

L'attività di sintesi della RNA polimerasi necessita dei quattro ribonucleosidi-trifosfati che entreranno a far parte della molecola di RNA (ATP,GTP, CTP e UTP) e ioni metallici (Mn²⁺ e Mg²⁺).

[modifica] RNA polimerasi procariotiche

Nei procarioti è presente una sola RNA polimerasi, coinvolta nel processo di trascrizione dei geni. Essa si associa di volta in volta a diverse subunità σ che ne permettono la localizzazione a livello dei promotori di specifici gruppi di geni.

[modifica] RNA polimerasi eucariotiche

Negli eucarioti sono presenti tre diverse RNA polimerasi. Tutte le polimerasi sono eteropolimeri costituiti da molte subunità differenti, che, singolarmente o in diverse combinazioni, catalizzano le fasi di inizio, di allungamento e terminazione della sintesi del polimero. Le tre polimerasi eucariotiche differiscono sia per la struttura che per la funzione dell'RNA neosintetizzato: la polimerasi-1 presiede alla sintesi degli RNA-ribosomiali, la 2 catalizza la sintesi degli RNA-messaggeri, la 3 catalizza la sintesi degli RNA di trasferimento e dei piccoli RNA-ribosomiali. Tali polimerasi sono costituite da più di 10 subunità con funzioni diverse. Il complesso di trascrizione risulta così formato, oltre che dalla polimerasi e dal DNA-stampo, anche da molti fattori proteici di trascrizione che hanno la funzione di presiedere al riconoscimento della sequenza di inizio e delle fasi successive della polimerizzazione, oltre che quella di mediare ed integrare i messaggi di repressione e derepressione della fase di trascrizione.

Enzima	Geni trascritti
RNApolimerasi I	Geni per RNA ribosomiali 28S, 5.8S e 18S
RNA polimerasi II	Geni codificanti per proteine, geni per molti piccoli RNA nucleari(snRNA)
RNA polimerasi III	Geni per RNA transfer, RNA ribosomiali 5S, alcuni piccoli RNA nucleari(sRNA), piccoli RNA nucleolari(snoRNA) e piccoli RNA citoplasmatici(scRNA)