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脊索动物门是动物界最高等的门。动物背侧有一条脊索,分为三个亚门,其中尾索动物亚门和头索动物亚门可以合称为“原索动物”。它们共同特征包括:在生活史中的某个阶段具有脊索,中空的背神经管,咽鳃裂以及肛后尾。
少数学者提出将半索动物门也置于脊索动物门下,并命名为口索动物亚门。
脊索动物门 Chordata 可以分为三个亚门: 尾索动物亚门, 头索动物亚门 和 脊椎动物亚门。尾索动物幼虫期具有脊索和神经索,但在成体消失。头索动物终生保留脊索和神经索,但没有脊柱。在脊椎动物中, 脊索的作用由骨质脊柱代替。
通常说的脊椎动物学是指研究脊索动物的一个动物学分支,而非仅研究脊椎动物亚门。
现存的脊索动物之间的关系如下面的系统发生树所示。它和传统的分类类群没有很好的吻合, 所以对脊椎动物的分类还存在争论,尽管它们间的关系已经搞得很清楚了。
脊索動物
- 尾索动物亚门(Urochordata)
- 头索动物亚门(Cephalochordata):如文昌鱼
- 全头类(Craniata)
- Myxini or Hyperotreti (盲鳗)
- 脊椎動物亞門(Vertebrata)
- Cephalaspidomorphi (七鳃鳗)
- Gnathostomata (有颌脊椎动物)
- 软骨鱼类(Chondrichthyes)
- 硬骨鱼类(Teleostomi ~ Osteichthyes)
- 辐鳍鱼类(Actinopterygii)
- Sarcopterygii (肉鳍鱼类)
- Actinistia (腔棘鱼类)
- 肺鱼类(Dipnoi)
- Tetrapoda (四足脊椎动物)
- 两栖动物(Amphibia)
- Synapsida (合颞孔类)
- Anapsida (无颞孔类)
- Diapsida (双颞孔类)
- Reptilia (现代爬行类)
- Lepidosauria (有鳞类,如蜥蜴、蛇、巨蜥)
- Archosauria (初龙类)
- Crocodilia (鳄类)
- Dinosauria (恐龙类)
- 鸟纲(Aves)