Вірус
Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Інше значення — дивись Вірус комп'ютерний.
Вірус - дрібні неклітинні частки, що складаються з нуклеїнової кислоти (ДНК або РНК) і білкової оболонки. Є внутрішньоклітинними паразитами, розмножуючись тільки в живих клітинах, вони використовують їхній ферментативний апарат і переключають клітину на синтез зрілих вірусних часток - віріонів. Поширені всюди. Викликають хвороби рослин, тварин і людини. Здоровий людський організм реагує на віруси шляхом створення антивірусного протеїну, інтерферону, що не допускає поширення інфекції на сусідні клітини.
Зміст |
[ред.] Еволюційне походження
У процесі вивчення природи вірусів, після відкриття їх Д. І. Івановським (1892) формувалися уявлення про віруси яка про дрібні організми. Епітет “фільтрівний” згодом був відкинутий, тому що стали відомі фільтрівні форми або стадії звичайних бактерій, а потім і фільтрівні види бактерій. Найбільш правдоподібною є гіпотеза про те, що віруси походять з “утікача” нуклеїнової кислоти, тобто нуклеїнової кислоти, що набула спроможність реплікуватись незалежно від тієї клітини, із якої виникла смердота, хоча при цьому передбачається , що така ДНК реплікується з використанням структур цієї або іншої клітин.
На підставі дослідів фільтрації через градуйовані лінійні фільтри були визначені розміри вірусів. Виявилося, щор розмір найдрібніших із них становив 20-30 нанометрів, а найбільших - 300-400 нанометрів.
У процесі подальшої еволюції у вірусів змінювалася більше форма, аніж хім.будова. Таким чином, віруси, ймовірно, походять від клітинних організмів, і їх не варто розглядати, як примітивних попередників клітинних організмів.
[ред.] Будова і властивості
Розміри вірусів коливаються від 20 до 300 нм. У середньому віруси в 50 разів менші за бактерій. Їх не можливо побачити у оптичний мікроскоп, тому що їх розмір менший за довжину світлової хвилі.
Віруси складаються з різноманітних компонентів:
- серцевина - генетичний матеріал (ДНК або РНК). Генетичний апарат вірусу несе інформацію про декілька типів білку, що необхідні для утворення нового вірусу: ген, що кодує обернену транскриптазу й інші.
- білкова оболонка, що називають каспидом. Оболонка часто побудована з ідентичних повторюваних субодиниць - капсомерів. Капсомери утворюють структури з високою симетрією.
- додаткова ліпопротеїдна оболонка. Смердота утворена з плазматичної мембрани клітини-хазяїна. Смердота зустрічається тільки в порівняно великих вірусів (грип, герпес). Цілком сформована інфекційна частка називається віріоном.
[ред.] Класифікація
- Віруси класифікуються за серцевиною: ті що містять ДНК і ті що містять РНК - (ретро) віруси.
- За структурою капсомерів. Ізометричні (кубічні), спіральні, змішані.
- По наявності або відсутності додаткової ліпопротеїдной оболонки
- По клітинах-хазяїнах
Найбільш вживана в теперішній час класифікація вірусів запропонована лауреатом Нобелівської премії Девідом Балтимором. Вона побудована на типі нуклеїнової кислоти, що використовується вірусом для переносу спадкового матеріалу, та на тому, яким шляхом відбувається її експресія. Варто зазначити, що така класифікація не віддзеркалює філогенетичні зв'язки між видами вірусів, тому що віруси, згідно з загальноприйнятим зараз поглядом, мають механізми походження, відмінні від усіх інших організмів.
На відміну від клітинних організмів, генетична інформація яких зберігається у вигляді дволанцюгової ДНК, геном віруса може зберігатись як у вигляді дво-, так одноланцюгової нуклеїнової кислоти. При цьому цією кислотою може бути не обов'язково ДНК, але і РНК, матрична форма якої (м-РНК) використовується в клітинах як проміжний продукт при трансляції генетичної інформації в процесі синтезу протеїнів. РНК-геноми вірусів можуть бути закодовані в двох протилежних напрямках: або гени розташовані в напрямку від 5'-кінця молекули до 3'-кінця (позитивний напрямок, або +полярність), аналогічно напрямку розташування генів в м-РНК в клітинах, або гени вірусного геному розташовані в протилежному напрямку (негативний напрямок, або -полярність).
Таксономія вірусів в основних рисах схожа на таксономію клітинних організмів. Таксономічні категорії, що використовуються в класифікації вірусів, є такими (в дужках дані суфікси для утворення латинських назв):
Але в номенклатурі вірусів є і деякі особливості, що відрізняють її від номенклатури клітинних організмів. По-перше, назви не тільки видів і родів, але також рядів і родин пишуться курсивом; по-друге, на відміну від класичної ліннеєвської номенклатури, назви вірусів не є біномінальними (тобто утвореними з назви роду та епітету виду - докладніше див. в статті "Біологічна класифікація"). Зазвичай назви вірусів утворюються в формі [Хвороба]-вірус.
Загалом на теперішній час описано близько 80 родин, в які входять приблизно 4000 окремих видів вірусів.
Розподіл родин на ряди розпочався нещодавно, і проходить повільно; на теперішній час (2005 рік) виділено та описано діагностичні ознаки тільки трьох рядів, і більшість описаних родин є некласифікованими.
[ред.] Класифікація за типом генома
В даній класифікації назви типових представників таксонів переведені на українську мову в разі наявності загальноприйнятого наукового терміну; в інших випадках наведено міжнародно прийняту англійську назву згідно з постановою Міжнародного Комітету з таксономії вірусів (International Committee on Taxonomy of viruses).
ДНК-віруси
Група І - дволанцюгові ДНК-віруси (dsDNA viruses)
- Ряд Caudovirales (tailed bacteriophages).
- Родина Myoviridae - типовий представник: Ентеробактеріальний фаг T4
- Родина Podoviridae
- Родина Siphoviridae - типовий представник: Ентеробактеріальний фаг О
- Некласифіковані
- Родина Ascoviridae
- Родина Adenoviridae
- Родина Asfiviridae
- Родина Baculoviridae
- Родина Corticoviridae
- Родина Fuselloviridae
- Родина Guttaviridae
- Родина Herpesviridae - типовий представник: Вірус герпесу людини
- Родина Iridoviridae
- Родина Lipothrixviridae
- Родина Nimaviridae
- Родина Papillomaviridae
- Родина Phycodnaviridae
- Родина Plasmaviridae
- Родина Polyomaviridae - типовий представник: Вірус мавп 40
- Родина Poxviridae - типові представники: Вірус коровячої оспи, Вірус оспи людини
- Родина Rudiviridae
- Родина Tectiviridae
- Некласифіковані роди
- Мімівірус; типовий представник: Acanthamoeba polyphaga mimivirus (вірус амеби Acanthamoeba polyphaga) - номінально найбільший з відомих вірусів.
- Некласифіковані роди
Група II - одноланцюгові ДНК-віруси (ssDNA viruses)
- Некласифіковані бактеріофаги
- Родина Inoviridae
- Родина Microviridae
- Некласифіковані віруси
- Родина Geminiviridae
- Родина Circoviridae
- Родина Nanoviridae
- Родина Parvoviridae - типовий представник: Парвовірус Б19 (для розвитку потребує спільного інфектування з аденовірусами)
- Некласифіковані роди
- Рід Anellovirus; типовий представник: Спіральний вірус тено
- Некласифіковані роди
РНК-віруси
Група III - дволанцюгові РНК-віруси (dsRNA viruses)
-
- Родина Birnaviridae
- Родина Chrysoviridae
- Родина Cystoviridae
- Родина Hypoviridae
- Родина Partitiviridae
- Родина Reoviridae - типовий представник: Ротавірус діареї людини
- Родина Totiviridae
- Некласифіковані роди
- Рід Endornavirus; типовий представник: Вірус бобової гнилі
- Некласифіковані роди
Група IV - позитивно спрямовані одноланцюгові РНК-віруси ((+)ssRNA viruses)
- Ряд Nidovirales ("Гніздові" віруси)
- Родина Arteriviridae
- Родина Coronaviridae - типові представники: Коронавірус пневмонії, вірус SARS.
- Родина Roniviridae
- Некласифіковані
- Родина Astroviridae
- Родина Barnaviridae
- Родина Bromoviridae
- Родина Caliciviridae - типові представники: Norwalk-віруси табака та картоплі
- Родина Closteroviridae
- Родина Comoviridae
- Родина Dicistroviridae
- Родина Flaviviridae - типові представники: Вірус Жовтої лихорадки, Вірус Нільської ліхорадки, Вірус Гепатиту С
- Родина Flexiviridae
- Родина Hepeviridae - типовий представник: Вірус Гепатиту Е
- Родина Leviviridae
- Родина Luteoviridae
- Родина Marnaviridae
- Родина Narnaviridae - безоболонкові РНК-віруси
- Родина Nodaviridae
- Родина Picornaviridae - типові представники: вірус Поліомеїліту, Вірус Гепатиту А
- Родина Potyviridae
- Родина Sequiviridae
- Родина Tetraviridae
- Родина Togaviridae - типовий представник: Вірус Краснухи
- Родина Tombusviridae
- Родина Tymoviridae
- Некласифіковані роди
- Рід Benyvirus; типовий представник: Вірус жовтосудинного некрозу буряків
- Рід Cheravirus; типовий представник: Cherry rasp leaf virus
- Рід Furovirus; типовий представник: Soil-borne wheat mosaic virus
- Рід Hordeivirus; типовий представник: Barley stripe mosaic virus
- Рід Idaeovirus; типовий представник: Raspberry bushy dwarf virus
- Рід Machlomovirus; типовий представник: Maize chlorotic mottle virus
- Рід Ourmiavirus; типовий представник: Ourmia melon virus
- Рід Pecluvirus; типовий представник: Peanut clump virus
- Рід Pomovirus; типовий представник: Potato mop-top virus
- Рід Sadwavirus; типовий представник; Satsuma dwarf virus
- Рід Sobemovirus; типовий представник: Вірус бобової мозаїки
- Рід Tobamovirus; типовий представник: Вірус тютюнової мозаїки
- Рід Tobravirus; типовий представник: Tobacco rattle virus
- Рід Umbravirus; типовий представник: Вірус плямистості моркви
- Некласифіковані роди
Група V - негативно спрямовані одноланцюгові РНК-віруси ((-)ssRNA viruses)
- Ряд Mononegavirales (несегмнтовані негативно спрямовані РНК-віруси)
- Родина Bornaviridae - типовий представник: Borna disease virus
- Родина Filoviridae - типовий представник: Вірус Еболи
- Родина Paramyxoviridae - типовий представник: Вірус Кіру
- Родина Rhabdoviridae - типовий представник: Вірус Сказу
Сегментовані негативно спрямовані РНК-віруси
-
- Родина Arenaviridae
- Родина Bunyaviridae - типовий представник: Hantavirus
- Родина Orthomyxoviridae - Віруси Нежиті
- Некласифіковані роди:
- Рід Deltavirus; типовий представник: Вірус Гепатіиту-дельта
- Рід Ophiovirus; типовий представник: Citrus psorosis virus
- Рід Tenuivirus; типовий представник: Вірус сторкатості рису
- Рід Varicosavirus; типовий представник: Вірус роздутості жилок салату
- Некласифіковані роди:
ДНК- та РНК-віруси, що здійснюють зворотню транскрипцію
Група VI - одноланцюгові зворотньо-транскрипційні РНК-віруси (ssRNA-RT viruses)
-
- Родина Metaviridae
- Родина Pseudoviridae
- Родина Retroviridae - Ретровіруси, типовий представник: HIV 1
Група VII - дволанцюгові зворотньо-транскипційні ДНК-віруси (dsDNA-RT viruses)
-
- Родина Hepadnaviridae - типовий представник: Вірус Гепатиту В
- Родина Caulimoviridae - типовий представник: Вірус мозаїки кольорової капусти
