SMILES
Wikipedia
SMILES är en förkortning av engelskans Simplified Molecular Input Line Entry System ungefär förenklat molekylärt radinmatningssystem. SMILES är ett sätt att otvetydigt representera kemiska strukturer i form av textsträngar av ASCII-tecken. Varje molekyl, atom eller jon kan utryckas med en SMILES-kod som är unik för ämnet. Varje SMILES kan bara motsvara en struktur, men varje struktur kan representeras av flera olika SMILES.
SMILES används av molekylritprogram och databaser för kemiska föreningar. Dessa program kan vanligen både rita strukturer från SMILES och konvertera strukturer till SMILES. SMILES-filer har filändelsen *.smi.
Härvid använd de vedertagna kemiska tecknen för B, C, N, O, P, S, F, Cl, Br och I alla övriga anges inom parates t.ex. (Fe) för järn. Vidare tillskrivs varje ämne sitt maximala antal väten i enlighet med sin valens således blir metan C och etanol CCO. Dubbelbindningar representera med =, således blir eten C=C och trippelbindningar representera med #, således blir acetylen C#C. Vidare blir representeras greningar av att atomen/gruppen innesluts i parantes således blir diklormetan C(Cl)Cl och ättiksyra CC(O)O. Ringar representeras att den gemensamma atomen i kedjan tillskrivs ett nummer, således blir cyklohexan C1CCCCC1. I aromatiska ringar skrivs atomerna med små bokstäver, således blir bensen c1ccccc1. Stereoisomerer kan uttryckas med \ och / (detta är dock inte nödvändigt) E-2-buten C\C=C\C och Z-2-buten C/C=C\C.
